Ο Γιάννης Οικονόμου γεννήθηκε στη Λαμία το 1973.
Είναι απόφοιτος του τμήματος Φυτικής Παραγωγής του Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών. Είναι, επίσης, κάτοχος μεταπτυχιακού τίτλου σπουδών στην Παγκόσμια Πολιτική Οικονομία του τμήματος Πολιτικής Επιστήμης και Διεθνών Σχέσεων του Πανεπιστημίου Πελοποννήσου. Έως το 2019 δραστηριοποιούνταν επαγγελματικά και επιχειρηματικά στο χώρο των τροφίμων.
Στις εθνικές εκλογές του 2019 εξελέγη Βουλευτής Φθιώτιδας με τη Νέα Δημοκρατία.
Από τον Ιανουάριο του 2021 έως και τον Αύγουστο του ίδιου έτους διετέλεσε Υφυπουργός Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων, αρμόδιος για θέματα Κοινής Αγροτικής Πολιτικής.
Ο Γιάννης Οικονόμου από τον Αύγουστο του 2021 ανέλαβε καθήκοντα Υφυπουργού παρά τω Πρωθυπουργώ και Κυβερνητικού Εκπροσώπου.
Στις εκλογές του Ιουνίου του 2023 εξελέγη ξανά Βουλευτής Φθιώτιδας και ανέλαβε το χαρτοφυλάκιο του Αναπληρωτή Υπουργού με αρμοδιότητα τον Αθλητισμό.
Είναι παντρεμένος με την Αγγελική Ζορμπαλά και έχουν ένα γιο, τον Δημήτρη.